Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms