Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNSTRNQ9Y448 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms