Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DTX4Q9Y2E6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms