Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms