Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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