Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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