Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms