Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPC1L1Q9UHC9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms