Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms