Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms