Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms