Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms