Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms