Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLN6Q9NWW5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLN6Q9NWW5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN6Q9NWW5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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