Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms