Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms