Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMMDC1Q9NPL8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMMDC1Q9NPL8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms