Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IL1RAPQ9NPH3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms