Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms