Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms