Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPNS1Q9H2V7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPNS1Q9H2V7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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