Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms