Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms