Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1BQ9BZX4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms