Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms