Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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COL25A1Q9BXS0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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COL25A1Q9BXS0 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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COL25A1Q9BXS0 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms