Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms