Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms