Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPAS2Q99743 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPAS2Q99743 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms