Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms