Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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C2orf48Q96LS8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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