Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF183Q96D59 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms