Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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