Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms