Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms