Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms