Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RASGEF1AQ8N9B8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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