Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms