Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms