Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP54Q7Z3B4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms