Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms