Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNDC1Q76NI1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms