Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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