Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD4L3Q6VB84 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms