Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms