Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms