Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD54Q6NXT1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms