Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms