Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms