Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms